A definitive haplotype map of structural variations determined by microarray analysis of duplicated haploid genomes

Tomoko Tahira, Koji Yahara, Yoji Kukita, Koichiro Higasa, Kiyoko Kato, Norio Wake, Kenshi Hayashi

研究成果: ジャーナルへの寄稿学術誌査読

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抄録

Complete hydatidiform moles (CHMs) are tissues carrying duplicated haploid genomes derived from single sperms, and detecting copy number variations (CNVs) in CHMs is assumed to be sensitive and straightforward methods. We genotyped 108 CHM genomes using Affymetrix SNP 6.0 (GEO#: GSE18642) and Illumina 1M-duo (GEO#: GSE54948). After quality control, we obtained 84 definitive haplotype consisting of 1.7. million SNPs and 2339 CNV regions. The results are presented in the database of our web site (http://orca.gen.kyushu-u.ac.jp/cgi-bin/gbrowse/humanBuild37D4_1/).

本文言語英語
ページ(範囲)55-59
ページ数5
ジャーナルGenomics Data
2
DOI
出版ステータス出版済み - 2014

!!!All Science Journal Classification (ASJC) codes

  • バイオテクノロジー
  • 生化学
  • 分子医療
  • 遺伝学

フィンガープリント

「A definitive haplotype map of structural variations determined by microarray analysis of duplicated haploid genomes」の研究トピックを掘り下げます。これらがまとまってユニークなフィンガープリントを構成します。

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